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论文:Error Corrective Boosting for Learning Fully Convolutional Networks with Limited Data
会议:MICCAI -2017 (MICCAI 是医学影像分析研究领域的顶尖年会)
1、contributions:
(1)提出了一个SD-Net的网络架构,十分适合分割brain图像
(2)提出了ECB的自动纠错的分割训练机制,原理为在训练过程中迭代更新类别分割权重,通过为分割错误率高的类分配更高的权重来实现;
(3)提出利用辅助生成的Label进行预训练训练,再利用人工标注的数据fine-tune模型,解决训练label的限制;
注意:文章指出 这项工作是第一个FCNN模型用于整个大脑的分割.
2、提出的方法:
1)首先利用已有的分割工具将unlabeled data进行分割得到Auxiliary Labels预训练分割网络SD-Net
2)利用人工标注的label,对辅助label训练的网络进行微调训练,优化网络
3、SD-Net网络架构:
架构细节:
1)U-Net的skip connection: 1)获取上下文信息;2)提供一个梯度回传机制
2)unpooling from DeconvNet: 为分割小的结构提供了优势
具体方式:using the saved indices with maximum activation during max pool-ing of the corresponding encoder block. The remaining locations are filled with zeros.
3)7×7的convolution: 可以在最小的encoder上保证感受野,捕获完整的mask
4、训练的Loss Function:
当前的挑战 : 类别不均衡和解剖边界分割不准确的问题
(i)weighted multi-class logistic loss :权重解决class-imbalance
( ii ) Dice loss.
5、ECB训练纠错机制:
在训练过程中,随着训练epoch的进行,ECB迭代地优化Loss的权重,将准确率低的类增大Loss权重;
关于权重的设置:
当epoch=1时:
(1)第一个部分:通过中位数频率,均衡数据集分割类别,fl小的值反而大
(2)第二个部分:在边界区域增强权重
当epoch>1时:
其中:
q=0.05
fl表示第l类在训练数据集中的像素出现频率
the indicator function I, the training segmentation S(训练的分割Label),the 2D gradient operator ?(梯度)
6、辅助标签auxiliary label:
The auxiliary labels are created with FreeSurfer [6].
The auxiliary labels are created with FreeSurfer [6].
7、Results
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